Science and Technology

New research reveals regular patterns in three-body gravitational interactions, challenging traditional views of purely chaotic behavior.

宇宙的隐藏规律:三体问题研究新解

Self portrait, Image credit: Dr. Alessandro Alberto Trani 宇宙的隐藏规律:三体问题研究新解 几个世纪以来,三体问题一直困扰著数学家和物理学家,它描述了太空中三个质量体之间看似不可预测的引力互动。传统上,由于其混乱本质,这个问题被认为无法求解。然而,这个天体之谜如今正在被重新审视。来自哥本哈根大学尼尔斯·玻尔研究所的亚历山德罗·阿尔贝托·特拉尼博士(Dr. Alessandro Alberto Trani)的突破性研究揭示,这些互动实际上展现出令人惊讶的规律性,挑战了人们长期以来对宇宙混沌的既有认知。他的研究最近发表在《天文学与天体物理学》期刊上。 近期,我们有幸采访了特拉尼博士。在交谈中,他分享了对这个复杂的天体三体问题的最新研究与见解。他的研究在天体运行的混沌中发现了「规律性孤岛」,表明这些运动结果并非完全随机,而往往可以根据初始条件(如位置、速度和接近角度)进行可预测的推算。 让我们一同深入探讨特拉尼博士的革命性研究,了解这一发现如何增进我们理解引力波和塑造宇宙的基本力量。以下是我们与亚历山德罗·阿尔贝托·特拉尼博士的专访内容。 This map, created from millions of simulations, shows ‘isles of regularity’ within three-body interactions. Image credit: Alessandro Alberto Trani 问:您能解释一下三体问题在传统数学和理论物理学中的理解,以及为什么它被认为是无解的吗?答:三体问题是一个历史悠久的课题,最早可追溯到牛顿时代,此后众多物理学、天文学和天体物理学的奠基人物都对此进行过探索。这个概念始于牛顿成功解决的二体问题,也就是描述两个天体之间的引力互动。二体问题被视为一个完全可预测系统,意味着我们能找到精确的解析解。只要知道两个天体的初始位置和速度,我们就能精确预测它们未来的运动轨迹。 然而,三体问题本质上完全不同,它是不可解系统。科学家最初对三体问题的深入研究是为了理解月球运动,因为地球、月球和太阳构成了一个三体系统——这是离我们最近的三体系统范例。早期科学家发现他们无法准确预测月球的轨道,特别是其岁差、章动和近地点(月球轨道中最接近地球的点)的推进。 庞加莱(Henri Poincaré)在十九世纪末发现,三体问题呈现出混沌行为。他的研究表明,初始条件的微小差异会导致截然不同的结果,使得长期预测变得不可能。自庞加莱的发现以来,研究人员一直依靠数值方法——电脑模拟——来研究这个问题,因为无法获得解析解。 近年来,我们开始使用统计方法来应对三体问题固有的混沌特性。透过将系统作为统计对象进行处理,我们希望能基于概率而非精确解来预测结果。在我最近的研究之前,人们普遍认为三体问题完全是混沌,我们使用统计理论利用这种混沌来预测相互作用的结果。 然而,我的研究表明,三体问题并非纯粹是混沌;它实际上是混沌与规律性的混合体。这意味著在混沌之中,系统有些区域是可预测。这一发现使我们对三体问题的理解变得更加复杂,并且挑战了单纯统计方法的有效性,因为规律性的存在影响了我们进行准确预测的能力。这表明我们需要发展新的方法,以同时考虑三体问题中混沌和规律性的层面。 问:最初是什么吸引您研究这个复杂的问题?它与您更广泛的研究兴趣有何关联?答:好奇心是驱使我研究这个复杂问题的主要动力。作为一名天体物理学家而非数学家,我是从天体物理学的角度来探讨这个问题。我的目标是理解三体互动,以及如何运用它来解决天体物理学的问题。 举例来说,就像早期科学家运用三体问题来理解地球和太阳对月球运动的影响一样,我们将其应用于黑洞和引力波的研究。在过去十年间,我们开始在地球上探测到引力波,这为我们开启了认识宇宙的新视窗。然而,我们仍未完全理解这些引力波的来源。 一种可能的解释是,这些引力波来自大质量恒星残骸——黑洞的相遇。当黑洞相遇时,会释放引力波能量,最终合并。我们可以用地球上的仪器探测到这些事件。我们知道这种三体互动很可能发生在被称为星团的巨大恒星集合体的中心。这些星团遍布宇宙各处,而它们的演化深受其核心区域三体互动的影响。 虽然我们无法直接观察黑洞之间的互动——毕竟它们不发光(它们是黑色的),但我们可以研究它们产生的引力波。对三体问题的理解帮助我们解读这些引力波,并深入了解星团内部的动力学特性。这项研究将我对天体物理学的兴趣与三体问题所带来的基本挑战巧妙地联系在一起。 问:您的研究表明在三体互动的混沌中存在著「规律性孤岛」。您能描述一下这是什么,以及它如何挑战了人们对三体问题的传统认知?答:当然可以!传统上,三体问题被认为是完全混沌,这意味著由于对初始条件极度敏感,预测三个天体在引力作用下的长期行为几乎是不可能。初始状态的微小差异可能导致截然不同的结果,使得系统变得不可预测。 然而,我的研究发现了在这片混沌景象中存在著我们称之为「规律性孤岛」的区域。这些是在可能的初始条件图谱中,系统表现出可预测、规律性行为的区域。为了帮助理解这一点,您可以想像一张图表,其中每个点代表三个天体的特定初始构型,每个点的颜色则基于互动的结果——例如,哪个天体最终会被抛出系统。 在一个纯粹的混沌系统中,所有点的颜色应该都是随机的,呈现出三种颜色的混杂状态——因为即使是非常接近的初始构型也会导致不同的结果。然而,我们观察到四个大型的、颜色分明的区域——以蓝色和绿色表示——在混沌的背景中清晰可见。在这些「规律性孤岛」中,即使我们改变初始构型,最终结果始终保持不变。 这些「孤岛」对应著三体系统快速分离的情况,其中一个天体被迅速抛出。由于互动时间很短,混沌行为没有足够的时间发展,因此结果是可预测。 这一发现挑战了传统认知,证明三体问题并非纯粹的混沌;相反,它呈现出混沌与规律性的混合状态。这些规律区域的存在意味著,在某些特定的初始条件下,我们可以更有把握地预测三体互动的结果。 让我们用太阳系来作为参照。虽然太阳系是一个包含许多天体的复杂系统,但它在长期内相对稳定。例如,地球-月球-太阳系统并不表现出典型三体问题中的混沌特性,因为月球一直保持在环绕地球的稳定轨道上。如果我们显著改变月球的轨道——比如给它一个额外的推力——它可能变得不稳定,潜在地导致混沌行为,月球最终可能摆脱地球的引力束缚。这就类似于三体问题中研究的不稳定情况。 总的来说,「规律性孤岛」揭示了在特定条件下,三体问题中确实存在可预测性。这一发现不仅挑战了长期以来的假设,也提升了我们在天体物理学中对复杂引力互动的建模和理解能力。 问:初始位置、速度和接近角度如何影响这些可预测的模式?答:在三体互动的「规律性孤岛」中,初始位置、速度和接近角度在影响可预测模式方面扮演著关键角色。我们知道这些初始条件与系统的最终结果之间存在著精确的对应关系。这意味著特定的起始构型会导致特定的结果,尤其是在这些规律区域内。 然而,我们尚未完全确定这种精确对应关系的具体样貌。虽然我们认识到在这些规律性孤岛中存在著明确的联系,但目前我们还缺乏一个全面的理论来解释和预测基于初始条件的结果。相比之下,对于混沌区域——「混沌之海」——我们可以通过统计方法在大量模拟中有效地预测结果。 「规律性孤岛」的挑战在于它们并不完全符合统计分析;它们的可预测性既不是随机,但也未被完全理解。克服这一障碍的一个潜在方法是使用机器学习和人工智能来预测这些区域及其结果。人工智能可能帮助识别传统方法无法立即发现的模式和对应关系。 然而,作为天体物理学家,我们的目标是开发可以理解和诠释的物理模型。虽然人工智能可以提供预测,但它可能无法提供我们所寻求的基本物理洞见。我们的目标是建立一个基于物理学的理论,解释初始条件如何在这些规律区域中导致特定结果,从而增进我们对三体互动的整体理解。 […]

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University of Cambridge scientists discovered that hibiscus flowers develop early petal patterns that create bullseyes to attract bees. Larger bullseyes enhance bee foraging efficiency, providing insights into plant evolution and potential impacts on biodiversity by Dr. Edwige Moyroud, Biologist, Geneticist, UK

大自然的隐藏艺术:揭示花卉图案的秘密蓝图

Self portrait, Image credit: Dr. Edwige Moyroud, University of Cambridge. 大自然的隐藏艺术:揭示花卉图案的秘密蓝图 发表于《科学进展》杂志的一项开创性研究中,剑桥大学桑斯伯里实验室(University of Cambridge’s Sainsbury Laboratory)的科学家们在植物生物学领域取得了一项重大发现。由艾德维格·莫伊鲁德博士(Dr. Edwige Moyroud)领导的研究团队发现了一种不可见的”预模式”,这种模式塑造了芙蓉花瓣上标志性的靶心设计。这一发现揭示了自然界中相当于”数字填色”系统的存在,该系统在任何可见颜色出现之前就已经开始活跃,为我们深入了解复杂的花卉图案形成过程提供了新的见解。 研究表明,这些早期发育蓝图在吸引授粉者,特别是蜜蜂方面起着至关重要的作用。令人惊讶的是,蜜蜂明显偏好较大的靶心图案,它们在具有更大图案的花朵间移动的速度快25%。这一发现凸显了植物进化与授粉者行为之间微妙的相互作用。通过比较不同的芙蓉花种类,包括濒危的小靶心芙蓉(芙蓉理查森尼)(Hibiscus richardsonii)和更常见的中等大小靶心芙蓉(三裂叶芙蓉)(Hibiscus trionum),科学家们揭示了这些早期微妙的图案如何能产生深远的生态影响。 这项研究不仅推进了我们对花卉如何发展其复杂图案的理解,还为探索生物多样性和植物-授粉者关系开辟了新的途径。从这项研究中获得的见解可能对保护工作产生巨大价值,潜在地为保护濒危植物物种及其授粉者提供新的策略。随着我们深入探讨莫伊鲁德博士的研究工作,我们将探索这些大自然的微观杰作如何塑造了丰富多彩的花卉世界以及依赖它们的生物。 Color map showing the cell area across the adaxial epidermis (top surface) of Hibiscus trionum petals during early development. The petal’s pre-pattern emerges early, before any visible coloration, when the petal is just

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Rhizobial nitrogen-fixing symbionts (fluorescently labeled in orange and green using genetic probes) residing within diatoms collected from the tropical North Atlantic. The diatom's nucleus is highlighted in bright blue by Mertcan Esti/Max Planck Institute for Marine Microbiology, Bremen, Germany

揭示新的海洋共生关系:根瘤菌与硅藻合作固氮并促进海洋生产力

Self portrait, Image credit: Max Planck Institute for Marine Microbiology, Bremen, Germany 揭示新的海洋共生关系:根瘤菌与硅藻合作固氮并促进海洋生产力 在一项突破性的发现中,科学家们揭示了传统上以豆科植物中固氮共生作用而闻名的类根瘤菌细菌(Ca. Tectiglobus diatomicola),也能与海洋硅藻形成合作关系以固氮。这一发现由来自马克斯·普朗克海洋微生物研究所、阿尔弗雷德·魏格纳研究所和维也纳大学的研究人员在最近的《自然》杂志中作了详细说明。此研究不但解决了一个长期存在的海洋之谜,并为理解海洋氮循环开辟了新途径。除了海洋生物学之外,这一发现还为革命性的农业技术和进化研究提供了希望,突显了这些细菌在海洋生产力和二氧化碳吸收中的关键作用。 氮是生命的基本组成部分,对于陆地作物和海洋植物的生长都是必不可少,而这些植物在地球氧气的生产中起着重要作用。虽然陆地上的豆科植物早已被人们熟知根瘤菌能将大气中的氮转化为可用形式,但海洋中的固氮机制却一直不太为人所知。发现根瘤菌也能与海洋硅藻共生并进行固氮,不仅增强了我们对海洋生态系统的理解,还弥合了陆地和海洋氮循环之间的一个重要知识差距。 这一新型共生关系具有深远的影响。类根瘤菌固氮并与硅藻交换碳的能力,使它们成为海洋固氮的关键角色,尤其是在其他固氮生物稀缺的区域。这一发现揭示了海洋生态系统的复杂性,并暗示了未来在农业领域的潜在应用。这些海洋共生体的进化特征有朝一日可能被用来培育固氮植物,从而彻底改变作物生产和可持续性。鉴于这些令人振奋的发现,我们有机会采访了该研究的主要科学家之一维布克·莫尔(Wiebke Mohr),深入探讨这项研究的意义。 The two research vessels, R/V Meteor and R/V Maria S. Merian, crossing paths multiple times during the expedition. Image credit: Max Planck Institute for Marine Microbiology, Bremen, Germany / Wiebke Mohr 问:能否带我们回顾一下这项研究的初期阶段?是什么促使你探索硅藻与类根瘤菌之间可能存在的共生关系?答:从全球的角度来看,海洋中的固氮微生物与陆地上的同类生物在生产力方面同样重要。海洋的固氮过程对于维持海洋生产力至关重要,因为就像在陆地上一样,海洋通过各种过程不断失去氮。为了维持生产力,必须补充氮,而固氮微生物在其中起到了关键作用。 之前,我们认为海洋中的大部分固氮作用是由一种叫做蓝藻的光合生物所完成。然而,在海洋的广大区域中,蓝藻的数量不足以解释测得的固氮量。这使得许多科学家猜测,可能有非蓝藻的微生物负责那些“缺失”的固氮作用。 大约25年前,我们知道这些生物存在于海洋中,但只能够通过编码固氮酶的基因片段来识别它们,却不能确定它们的真实身份。这些基因可以在细菌之间转移,因此仅凭基因很难确定生物的身份。在此之前,我们发现唯一能够在全球或区域范围内积极参与固氮的生物,要么是自由生活的蓝藻,要么是与其他生物共生的蓝藻。 我们对确定这些负责固氮过程生物的兴趣,源于了解这些微生物分布的区域以及它们在某些区域活跃的原因。这些知识可以帮助我们预测在未来,尤其是在面对气候变化的挑战时,固氮作用可能会发生怎样的变化。识别参与这一过程的具体生物是理解这些潜在变化的关键,使得这项研究既重要又充满吸引力。 问:你能否描述一下2020年在北大西洋的探险,并解释一下你们是如何发现矽藻和类根瘤菌之间的共生关系?答:2020年,我的团队和我从不来梅出发前往热带北大西洋,参与了一次由两艘德国研究船组成的探险。我们从该地区收集了数百升海水,以识别和量化这些神秘固氮生物的重要性。

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Facial wound of adult male orangutan Rakus (photo taken two days before applying the plant dressing) by Armas/Suaq Project

突破性发现:红毛猩猩首次被发现用药草处理伤口

Self portrait, Image credit: Dr. Isabelle Laumer 突破性发现:红毛猩猩首次被发现用药草处理开放性伤口 最近,马克斯·普朗克动物行为研究所(Max Planck Institute of Animal Behavior)和印度尼西亚国立大学的生物学家做出了突破性的观察。首次发现一只野生动物用药用植物治疗伤口。这一行为记录在一只雄性苏门答腊猩猩身上,它用一种具有抗炎和止痛特性的攀缘植物的树液治疗面部受伤。该发现揭示了药用植物在伤口护理中可能具有古老的进化起源。 在《科学报告》上发表的研究中,来自德国康斯坦茨马克斯·普朗克动物行为研究所和印度尼西亚国立大学的认知和进化生物学家报告了这一发现。研究由Caroline Schuppli博士和Isabelle Laumer博士领导,在印度尼西亚Suaq Balimbing研究地点进行。观察中,雄性猩猩拉库斯(Rakus)被发现用咀嚼过的Fibraurea tinctoria植物叶子涂抹在伤口上。这种植物在东南亚传统医学中因其疗效广为人知。研究表明,拉库斯的行为是有意且专注,标志着动物自我药疗研究的重要发现。这一行为展示了猩猩复杂的认知能力和解决问题的能力,促使进一步探讨人类和其他类人猿使用药用植物的进化根源。以下是与Isabelle Laumer博士的问答,提供了更详细的解释和发现的意义。 Facial wound of adult male orangutan Rakus (photo taken two days before applying the plant dressing). Image credit: Armas/Suaq Project 问: 你的研究强调了拉库斯不仅将植物汁液涂在他的伤口上,还用嚼碎的叶子覆盖伤口。你能告诉我们你是如何开始这项研究?以及为什么要进行这项研究?答: 该研究自1994年以来一直在此地进行。这里是一片泥炭沼泽森林,栖息着大约150只极度濒危的苏门答腊猩猩。该研究由卡尔·范·沙克教授(Professor Dr. Carl van Schaik)创立,他当时在寻找一个适合研究这些猩猩的地点。他发现这里的猩猩相对较为社交,主要原因是这里有丰富的水果供应和已建立的等级制度。这意味着我们在这里观察到的猩猩打斗和受伤的情况较少。这个地点不是一个保护区,而是一片猩猩自由生活的野生森林。 雌性通常留在该地区,而雄性猩猩在青春期或青春期后会分散开来,以建立新的领地。例如,拉库斯并不是出生在Suaq。我们在2009年首次观察到他,当时估计他大约20岁。他来自研究区域外,并在Suaq Balimbing研究区内建立了自己的栖息地。这个地点完全是野生,没有围栏,允许猩猩自由进出而不受人为干扰。 问: 能否简单介绍一下你的教育背景以及你为什么对这个领域感兴趣?答: 我是一名认知生物学家。最初,我研究的是小葵花凤头鹦鹉,这是一种印尼鸟类,以其聪明和使用、制作及创新工具的能力而闻名。在攻读博士学位期间,我还研究了另一种同样使用工具的印尼物种——猩猩。研究这种高度智能的鸟类和猩猩为探索工具使用的进化提供了绝佳的机会。 我一直对类人猿特别感兴趣,尤其是因为它们濒临灭绝。对我来说,研究濒危动物至关重要。了解它们的行为和智力让我能够与他人分享这些见解,强调它们与人类的惊人相似性。这种意识不仅对其他研究人员重要,对公众也同样重要,因为它能促进更广泛的理解并推动保护这些非凡生物的努力。 问: 劳默博士,你能描述一下首次观察到雄性苏门答腊猩猩拉库斯使用Fibraurea

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Discovering Japan's floral treasures, the Spiranthes hachijoensis orchid emerges as the latest species to be classified by Dr. Suetsugu Kenji, Botanist, Scientist, Japan

揭示日本植物的神秘面纱:须藤健治博士(Dr. Kenji Suetsugu)的新植物发现

Self portrait, Image credit: Dr. Suetsugu Kenji 揭示日本植物的神秘面纱:须藤健治博士(Dr. Kenji Suetsugu)的新植物发现 在植物新品種日益稀少的當下,日本最近發現了一種新的仙燈草屬植物,標誌着植物科學領域的一次重要進步。這種仙燈草因其精緻且半透明的外觀,以及依賴真菌而非光合作用來獲取營養的習性,在植物學中獨樹一幟。此新發現的植物,被命名爲吉野屋若律希夢(Relictithismia kimotsukiensis),不僅代表了一個新的物種,還代表了一個全新的屬,這在日本近百年來是首次。 這一發現發生在日本的植物研究熱區,該區域以其詳細且廣泛的植物研究而知名,凸顯了即便是在被研究得最透徹的環境中,依然潛藏着未解之謎。神戶大學的須藤健治教授(Dr. Kenji Suetsugu),在非光合植物研究方面是一位領先的研究者,並領導了這項研究工作。他与业余和专业的植物学家合作,突显了持续不懈的探索和跨学科研究在揭示自然界秘密中的关键作用。 Relictithismia kimotsukiensis, a primitive member of its lineage, offers a living snapshot of its family’s early evolutionary history. Named to reflect its ancient roots. Image credit: Dr. Suetsugu Kenji 深入理解生物进化与生态学 吉野屋若律希梦(Relictithismia kimotsukiensis)的发现远不止为植物学词汇增加了一个新物种,它对我们理解植物的进化和生存方式产生了深远的影响。这类植物为我们提供了森林生态的多样性及其复杂关系,而这些生态通常隐藏在落叶与幽暗的下层林区,揭露了一个鲜少被人探索的领域。 须藤健治博士对非光合植物的热情来源于他对植物生物学和生态学的广泛兴趣。他指出:“这些植物不同寻常的生存方式——不依赖光合作用,而是通过与真菌形成共生关系获取养分,开辟了一个新挑战及扩展我们对植物进化认识的丰富研究领域。” The Thismiaceae family, nourished by subterranean fungi,

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Bonnet macaques (Macaca radiata) by Aman Raghuwanshi, Dr. Bo Xia, Scientist, Genetic scientist, Molecular biologist, China, USA

揭秘人类无尾之谜:夏波博士(Dr. Bo Xia)的人类演化突破发现

Self portrait, Image credit: Dr. Bo Xia 揭秘人类无尾之谜:夏波博士(Dr. Bo Xia)的人类演化突破发现 翻译:夏波博士 在《自然》杂志最新发表的一篇吸引人的学术论文中,由夏波博士领导的纽约大学格罗斯曼医学院团队在研究中取得突破,揭示了人类和猿类不同于其他许多灵长类动物无尾的演化秘密。当前在哈佛大学担任哈佛学会青年学者并在博德研究所担任实验室负责人的夏博士,确认了一个特殊的遗传突变——在TBXT基因中的DNA插入,这一标记在人类和猿类中存在,而在猴类中则没有,它与尾巴的缺失有关。 这项开拓性的研究通过在不同物种之间精确的基因序列比较以及对小鼠的实验,揭示了这一特殊遗传插入如何影响尾巴的发育以及其在演化中的消失。夏博士的研究挑战了对所谓“无用”DNA的既定看法,发现了AluY DNA片段对TBXT基因功能以及其剪接过程的决定性影响,并进一步影响了演化进程中尾巴的发育。 在与夏波博士的对话中,我们深入了解了这一发现对我们理解人类演化的深刻意义。这项研究不仅为我们无尾形状的遗传基础提供了新的视角,也为灵长类的演化史、遗传调控以及我们与其他灵长类动物的细微遗传区别提供了新的见解。跟随我们探索夏博士在演化生物学和遗传学上的重大进展,这些进展突显了在灵长类演化过程中起作用的复杂遗传变异。 Bonnet macaques (Macaca radiata), Image credit: Aman Raghuwanshi 你能分享一下你的教育经历及其如何引领你走向当前研究领域吗?答:非常乐意。我出生并成长于中国四川,我的学术之路起始于位于北京的中国农业大学,在那里我完成了我的本科论文,那时我对遗传学和化学生物学的热情便开始萌芽。随后,我在北京大学投入了两年时间进行深入研究。为了扩展视野,我随后赴美国纽约大学继续我的研究生教育。这一段学习经历对我影响深远,它带领我至哈佛大学成为哈佛学会的青年学者,并在博德研究所建立自己的独立实验室并担任实验室负责人。这些经历极大地促进了我在基因调控和演化遗传学领域的研究探索。 是什么个人体验或学术兴趣驱使你深入研究人类及猿类缺乏尾巴的遗传原因?答:这背后是个人经历与学术追求有机结合的故事。从小,我就对自然界的诸多奇观感到好奇,尤其是人类为何与其他动物不同,比如没有尾巴。这一疑问伴随我成长,直到在纽约大学深造期间,我积累了大量实验与计算遗传学的知识与技能。我的研究兴趣之所以突然聚焦于此,源于一个个人经历——一场小车祸让我尾骨受伤。长期的恢复期让我不得不每日都思考尾骨的作用,想起这个小时候好奇的问题,进而激发了我对此科学探索的兴趣。正是在我的博士研究期间个人经历和科研能力的有机结合,我开始探讨我们的祖先如何在演化中失去了尾巴。 你的工作深入解析了基因组之谜。能否分享你是如何探索基因调控及其更广泛的意义?答:非常乐意分享。我的研究核心聚焦于基因组——生命的复杂设计图,它调控了生物的发育与功能。我主要研究基因调控,这是一个涉及基因何时表达及表达多少量的复杂过程。这一研究领域非常广泛,包括从基础生物学机制到可能的治疗应用等各个层面。 我的工作吸引人之处在于揭开基因表达模式的神秘面纱,尤其是在特定条件下基因如何被激活或被抑制。比如,并非所有基因在所有细胞类型中都活跃,有些仅在特定环境下表达。这种选择性表达对于生物的发展和健康至关重要,而这一过程的任何干扰都可能导致疾病。 这种对基因表达和调控的深刻理解构成了我们研究的基石。它不仅加深了我们对于发育性状和疾病遗传基础的了解,而且开辟了针对基因调控开发治疗手段的新途径。通过在这一领域的深入研究,我们希望揭示生命和健康的遗传调控细节。 你能谈谈AluY插入如何影响尾部发展以及它与TBXT基因的关系吗?答:TBXT基因,亦称作Brachyury(源自希腊语,意为“短尾”),因其突变型与尾巴特征相关而得名。这一基因在发育生物学领域的故事历史悠久且引人入胜。1927年,出生于基辅的女性科学家Nadine Dobrovolskaya-Zavadskaya首次发现了这一基因的突变小鼠——这一发现时间比我们对基因的本质认识还要早。直到1990年,德国科学家Bernhard Herrmann才正式从Brachyury突变小鼠中鉴定出该基因。TBXT基因在形成中胚层以及随后包括尾巴在内的重要结构发育中扮演关键角色。特别地,TBXT在促进生物体胚胎后侧的延伸过程中起着至关重要的作用,这对脊椎动物尾部的生长至关重要。TBXT基因在尾巴发展中的重要性也体现在遗传学研究成果里。这些研究发现了导致包括某些特定无尾品种的狗和猫在内的各种物种尾巴缺失或缩短的突变。 我们的发现–AluY序列插入到TBXT基因–直接体现了遗传突变如何显著改变基因的表达模式,并对生物体的发育产生显著影响。这个突变涉及约300个碱基对DNA插入TBXT基因的非编码区,从而显著改变基因的表达方式。虽然传统上研究人员可能会常常忽略非编码区域–比如内含子—里面DNA插入对基因功能的影响。但我们发现这个AluY序列与另一段相似序列呈现出“头对头”的位置相关性,这意味着它们可能会相互作用,从而影响基因的剪接过程。 为了简化对剪接过程复杂机制的理解,我经常借用电影剪辑的类比。正如导演根据剧本挑选来编排不同拍摄场景片段并剔除冗余镜头从而来构建故事线一样,基因转录为前体mRNA,经历剪接过程,去除非编码序列,最终形成指导蛋白质合成的成熟mRNA。我们所研究的AluY序列插入突变,能够改变TBXT基因的剪接过程从而产生不同版本的蛋白质,进而影响生物体的发展。 简而言之,AluY插入能够修改TBXT基因的表达方式,使其能够产生两种蛋白质亚型,而其默认或祖先状态下的基因只能产生一种蛋白质类型。由于这种插入,TBXT基因的表达变化为人类和猿类动物尾巴丧失的演化过程提供了解释。这揭示了影响基因调控的突变在发育和演化上的重大意义。 能分享一下在小鼠上应用AluY元素进行尾部发展实验的方法与成果吗?答:我们应用了CRISPR基因编辑技术构建了若干小鼠实验模型,这包括将人类的AluY元素导入到小鼠的基因里,以研究它对尾部发展的具体影响。最初,由于较短蛋白亚型的表达量未达到预期,AluY的添加并未如我们所预期地影响尾部长度。在调整方法后,以更贴近人类基因表达的方式,我们观察到部分小鼠明显尾部缩短,甚至有的小鼠一出生就无尾。这些发现验证了AluY插入对尾巴发育的关键作用,并暗示了随着时间推移基因功能变化的演化含义,同时可能指向了与先天性脊柱缺陷之间的潜在联系。 人类尾巴演化性丧失与脊柱问题及先天性缺陷之间存在何种联系?答:我们从猴祖先到现代人类及猿的尾巴消失,标志着演化中一个显著的转折点,这在演化生物学上被视为一种特征丧失。这种变化可能涉及到一种演化上的权衡,其中失去了尾巴这一身体特征,可能导致现代人类在某些脊柱问题上更加敏感。 在对小鼠模型的研究中,我们发现负责尾巴丧失的遗传变化可能与神经管闭合缺陷的风险增加相关。具体而言,携带该突变的小鼠有更大的比例出现这些缺陷,这暗示了演化过程中TBXT基因的突变可能也对人类发生这类状况的风险有所贡献,该状况的发生率约为每1000至2000次出生中的1次。 值得强调的是,神经管发育缺陷的风险受到遗传学、环境和营养因素共同影响的作用。例如,对孕妇进行叶酸补充已被证明能显著降低这种风险。这凸显了我们的演化历史中遗传变化与当前健康状况之间错综复杂的联系,强调了基因与环境之间在塑造健康方面的复杂互动。 尾巴丧失的遗传机制如何深化我们对灵长类演化特别是与旧世界猴分化的理解?答:关于尾巴丧失遗传原理的研究揭示了猿类与旧世界猴约2500万年前分化这一显著的演化事件。虽然最早出现的猿类约在2000万年前就已无尾,我们的研究发现了一个与此演化时间点相符的遗传变异。虽然缺乏确切的化石证据来精确鉴定这些遗传改变的具体发生时间,但我们的发现认为这种变异是猿类与旧世界猴在演化上走向不同路径的显著标记。 这次导致尾巴消失的遗传变异象征着早期类人猿可能经历的更广泛适应性变化,这可能影响了它们的移动方式。考虑到在树栖猴中尾巴的作用,它们的缺失可能预示了猿类向陆地生活方式的演化转变,可能为后来的直立行走奠定了基础。因而我们发现的这类遗传变异可能对灵长类的演化产生了广泛影响,不仅是尾部的发育,也包括其它解剖学和运动适应性的变化。 要全面理解尾巴丧失在灵长类演化中的作用,对遗传学和化石记录的持续研究是必不可少的。我们旨在探讨遗传变异、解剖学改变及其环境适应性之间的复杂相互作用,这些是指导灵长类演化历程的关键因素。 你的研究如何阐明了所称的“遗传暗物质”及其在基因表达中的角色?答:“遗传暗物质”指的是我们基因组中那些不编码蛋白质且广泛的非编码DNA区域。随着科学深入的理解,这部分原本被认为是“无用的DNA”,现在被视为含有对控制基因表达至关重要的调控元件。这些调控元件关系到基因何时以及如何被激活或抑制,以及它们如何参与产生不同的基因变体。 在我们的研究中,我们对这些非编码区域进行了深入的探索,特别关注了如TBXT基因中的AluY插入这类突变。我们的研究展示了非编码DNA是如何通过改变基因的读取方式来影响关键的发育过程,进一步强调非编码DNA在细胞功能和整体发展中复杂的调控机制中发挥的关键作用。 自从人类基因组计划以来,包括我在内的众多科学家已致力于解读人类基因组这本“庞大的书籍”。我们的目标是解明遗传暗物质中的调控元件是如何影响人类的发育和疾病的。这一雄心勃勃的项目需要全球数以千计科研人员的合作,从而完全理解我们基因组中非编码区域的功能。 夏波博士的实验室

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Prototype of an artificial neuron: Nanofluidic slits function similarly to ion channels, facilitating communication between neurons. The transport of ions, achieved through ion clusters, enables this interaction by © Paul Robin, ENS Physics Laboratory (CNRS/ENS-PSL/Sorbonne University/University of Paris).

罗宾博士(Dr. Paul Robin)的离子计算革命:人工神经元塑造未来电子记忆新纪元

Self portrait, Image credit: Dr. Paul Robin 罗宾博士(Dr. Paul Robin)的离子计算革命:人工神经元塑造未来电子记忆新纪元 我们最近有幸采访了保罗·罗宾博士(Dr. Paul Robin),他曾在ENS接受Lydéric Bocquet的指导,目前就职于奥地利科学技术研究所。作为人工神经元领域的领军人物,罗宾博士及其团队的研究成果已于2021年8月6日在《科学》杂志上发表。他们的工作聚焦于脑启发式电子学,并且是与法国国家科学研究中心(CNRS)和巴黎高等师范学院 – PSL的科学家们的合作项目。该研究强调利用离子开发人工神经元,探索了使用单层水的石墨烯纳米缝隙进行类似神经元的信号传输。此项研究突显了纳米流体学在开发能效电子学中的重要性,旨在复制人脑以极低能耗运作的能力及其在电子记忆和人工智能中的潜在应用。在与罗宾博士的对话中,我们深入地了解了他的开创性工作,进一步阐明了他在人工神经元和脑启发式电子学研究方面的重要影响。 Prototype of an artificial neuron: Nanofluidic slits function similarly to ion channels, facilitating communication between neurons. The transport of ions, achieved through ion clusters, enables this interaction. Image credit: © Paul Robin, ENS Physics Laboratory (CNRS/ENS-PSL/Sorbonne University/University of Paris).

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A chemical structures of compounds A-D used to-weave the crystalline patches by Dr. Panče Naumov, Material Scientist, NYU Abu Dhabi, USA

Panče Naumov教授和张红雨教授研究团队联合开发出首款柔性有机晶体的编织材料

Dr. Panče Naumov, Image credit: NYU Abu Dhabi Panče Naumov教授和张红雨教授研究团队联合开发出首款柔性有机晶体的编织材料 美国纽约大学阿布扎比分校智能工程材料中心及智能材料实验室的Panče Naumov教授和中国吉林大学超分子结构与材料国家重点实验室的张红雨教授及其研究团队在智慧材料领域又取得了令人瞩目的突破,他们开发出了首款完全由柔性有机晶体制成的编织材料。这项创新性的工作最近发表在《自然通讯》上,它将传统的一维晶体转化为坚固而灵活的二维结构。这种材料的强度比原始晶体高出15倍,而且在极低温度下也能保持其灵活性,在柔性电子和太空探索领域应用具有巨大的潜力。 A chemical structures of compounds A-D used to-weave the crystalline patches, Image credit: Dr. Panče Naumov 这项研究代表了对有机晶体的理解发生了重大转变,因为传统上人们认为有机晶体是硬而脆的材料。该团队采用了一种创新的方法,将晶体编织成各种纹理,如平纹、斜纹和缎纹,从而产生了一种轻便但机械强大、在广泛温度范围内都表现出热稳定性的织物。这些性能超越了许多传统聚合物和弹性体材料。此外,这种材料的光学透明度为光学计算开辟了新的可能性,研究人员成功地使用这些编织晶体进行简单的逻辑功能实现。 该团队创造性地将历史悠久的编织技术应用在了晶体上。将细长的晶体结构编织成二维织物显著增强了其机械稳定性和坚固性。虽然在可扩展性方面仍然存在挑战,尤其是在选择均匀尺寸的晶体进行编织方面,但未来的自动化可能会简化这一过程,增强这项技术的实际应用。不同编织模式(如平纹、斜纹和缎纹)的机械强度差异也揭示了基于编织方法的多样化应用潜力。这些编织有机晶体在柔性电子和太空探索等领域具有巨大的应用前景。它们对低温和机械冲击的抵抗力,以及编织结构内的协同作用增强,使其具有独到的应用有价值。这项工作是与中国吉林大学长期合作的一部分,在该合作中采用常见的化学方法,已经开发了多种荧光特性的多样化材料库,增强了它们在各种应用中的实用性。编织有机晶体技术的发展标志着材料科学领域的一个重要里程碑。它挑战了人们对晶体作为刚性和不灵活物质的传统看法,揭示了它们作为适应性强、柔韧材料的潜力。这一突破不仅拓宽了它们在柔性电子产品以及其他需要柔韧材料的应用领域的前景,而且预示着材料科学的一个新时代。在这个新时代,柔性与结构的完美融合为技术进步开辟了新的前沿,巩固了这些创新材料在未来科学和技术创新中的重要角色。 Naumov教授的研究重点是智能材料,他的实验室在众多著名出版物中发表了很多智能材料研究工作,包括智能晶体和与石油化学相关的材料。这些智能材料对外部刺激(如光、热和机械力)做出响应,具有独特的特性,如耐用性、自我修复和适应性。他对这些材料的研究兴趣源于它们能够转换能量。这些晶体的动态响应能力也得到了广泛的研究,它们对外部刺激的适应性是一个显著特点,突显了材料属性与基本物理原理之间的相互关系。这个研究不仅推动了我们对智能材料的理解,还强调了基本物理原理在现代科学研究中的重要性。 向Panče Naumov教授和张红雨教授团队表示感谢,他们的工作为这一领域的进展作出了重要贡献。

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Scientists have discovered the history of Ekgmowechashala, a 30-million-year-old primate from North America. Comparing it with similar species in China, they suggest it was a migratory species, shedding light on primate evolution and environmental impacts. The illustration depicts Ekgmowechashala, the last pre-human primate in North America, by Kristen Tietjen of the KU Biodiversity Institute and Natural History Museum.

艾克莫韦查夏拉(Ekgmowechashala)的迁徙:人类之前居住在北美的最后一种灵长类动物

Scientists have discovered the history of Ekgmowechashala, a 30-million-year-old primate from North America. Comparing it with similar species in China, they suggest it was a migratory species, shedding light on primate evolution and environmental impacts. The illustration depicts Ekgmowechashala, the last pre-human primate in North America, Image credit: Kristen Tietjen of the KU Biodiversity Institute

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Dr. Melvin M. Vopson, Physicist, Information Scientist, UK

揭示并探索现实的边缘:梅尔文·沃普森博士(Dr. Melvin M. Vopson)对物理学、信息理论和宇宙本质的研究及物理与数据的互联

Self portrait, Courtesy: Dr. Melvin M. Vopson 揭示并探索现实的边缘:梅尔文·沃普森博士(Dr. Melvin M. Vopson)对物理学、信息理论和宇宙本质的研究及物理与数据的互联 作者: Peter D Gowdy, Ph.D., 翻译: 艾德琳 梅尔文·沃普森博士(Dr. Melvin M. Vopson)在科学领域的探索之旅既充满复杂性也极富魅力,这一切始于他在中央兰开夏大学攻读博士学位时,对磁性数字数据存储领域的好奇和探索。此初步尝试为他理解数字数据技术及其背后的深层物理过程奠定了基础。在2002年完成博士学位后,他在约克大学进行了博士后研究,在那里他更深入地研究了磁性数据存储,将焦点从存储介质转移到读/写换能器的复杂机制。这种兴趣和专业知识的发展,为他在磁性数字数据存储领域的领军企业——希捷科技公司(Seagate Technology)中担任关键角色奠定了基础。2006年,他加入了英国国家物理实验室,为他的职业生涯迎来了重大转变。在那里,他开始探索多铁性材料,这是一种在数据存储中具有潜在应用的新型材料。他的工作产生了具有影响力的文章,展示了多铁性材料在革新信息存储方面的巨大潜力。 自2012年起,他的学术生涯在朴茨茅斯大学进一步蓬勃发展,标志著更理论化方法的转变。在此期间,他发现了“多热量效应”,并开发了铁电体和反铁电体的极化反转模型。值得注意的是,他对反铁电学的研究成为他目前在资讯物理学领域追求的跳板。 在研究多状态数字数据存储技术时,他遇到了一个挑战,即如何为具有超过两种物理状态的单元分配记忆状态,这与传统的二进位储存单元有所不同。这一难题让他接触到了香农资讯理论和兰道尔原理,从而在资讯物理学方面做出了新的贡献。 Courtesy: Dr. Melvin M. Vopson 信息熵与模拟宇宙理论背后的灵感 沃普森博士对信息熵以及它与模拟宇宙理论之间关联的研究起始于一系列连续的思考,而促成他在2019年发表关于质量-能量-信息(M/E/I)等效原理的文章。他将爱因斯坦的质量-能量等价和兰道尔原理(将信息等同于能量)结合起来,提出了一个开创性的观点:质量、能量和信息在根本上是等价。这一原理不仅与现有的物理定律完美契合,还为诸如暗物质这样的现象提供了一种新的解释,可能将其重新概念化为信息。 M/E/I等效原理有趣地支持了模拟宇宙理论,这意味着构成我们模拟宇宙的数字比特可能表现为不可检测的质量,类似于暗物质。这一假说为宇宙的起源和本质、相互交织的物理学、信息论和形而上学推测提供了一个全新的视角。 简化信息动力学第二定律 简化信息动力学第二定律用通俗的话来说,它主张系统和过程在达到平衡时普遍趋向于最低的信息熵。这个概念与热力学第二定律形成鲜明对比,热力学第二定律断言孤立系统中的熵或无序性往往会随著时间的推移而增加。 沃普森博士的发现揭示了一个令人惊讶的转折:仅关注信息状态的系统,随着时间的推移表现出降低或恒定的熵,这与热力学熵恰恰相反。这对多个领域产生了深远的影响,挑战了遗传学、进化论和癌症研究等领域的既有理论。 模拟宇宙理论对我们理解现实的影响 尽管沃普森博士在物理学与信息理论交汇处的研究支持了模拟宇宙的哲学理论;重要的是要认识到,即使这种启示被证明是真实的,它也不会改变我们的日常生活。这一理论虽然有可能重塑科学和宗教信仰,但由于我们无法感知什么是真正的真实或模拟,所以我们的日常现实没有改变。他的发现将这一古老的哲学争论带入了科学的聚光灯下,尽管它们最初源于目标不同的研究。 克服挑战并开拓新的研究领域 将信息动力学第二定律的适用性扩展到各种不同的系统中,是一个重大的挑战。沃普森博士的初步研究虽然很有希望,但仅限于数字和遗传信息存储系统。将其扩展到其他领域对于将其确立为一个普遍法则至关重要。他预计这不仅会涉及个人的探索,还会激发科学界内的并行研究。 模拟宇宙的证据和对怀疑论的回应 信息动力学的第二定律是模拟宇宙最强有力的指标之一,它暗示了信息内容中的一种内在优化,这与计算机数据压缩技术相呼应。虽然这暗示了模拟宇宙的可能性,但确凿的证据仍然难以捉摸。沃普森博士最近的书籍《重新加载现实:科学论证模拟宇宙》更深入地探讨了支持这一假说的证据和理论,旨在促进广泛而包容的科学对话。 展望未来 未来的实验和研究,包括沃普森博士提出的M/E/I原理和物质概念DNA的测试,对于验证模拟宇宙理论和资讯动力学第二定律是首要的环节。整个科学界的合作努力和多样化的实验方法对于进一步探索这些开创性的想法至关重要。 多方面的影响 沃普森博士的研究超越了传统界限,影响了物理学、宇宙学、遗传学,甚至哲学。M/E/I 等效原理和资讯动力学第二定律的意义都是深远的,为宇宙的奥秘(包括暗物质、自然的对称性和基因突变的机制)提供了新的见解。这种跨学科的影响强调了我们的物理世界和资讯世界之间深刻的相互联系,为理解和创新带来了令人兴奋的新途径。

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