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Octopus bimaculoides in repose, Cassady Olson, Ragsdale Lab

八臂无限运动:揭秘章鱼非凡的灵活性

Clifton Ragsdale, PhD, Neurobiology, Image credit: Jordan Porter-Woodruff 分布式神经系统如何造就非凡的运动灵巧性 章鱼以其智慧和惊人的身体能力而闻名,其中最令人印象深刻的莫过于它们八条触手的灵巧性。这些灵活的附肢可以扭转、弯曲和卷曲,几乎可以进行无限范围的运动,使章鱼能够在周围环境中穿梭自如,操纵物体,并以惊人的精度捕捉猎物。但究竟是什么赋予了它们如此精细的控制能力呢? 芝加哥大学的研究人员揭示了这一谜题的关键:一种独特的神经系统,它能协调章鱼触手的复杂运动。这项突破性研究于2025年1月15日发表在《自然通讯》杂志上,揭示章鱼的触手并不仅仅由中央大脑控制,而是由组织成段的分布式神经元网络控制。这使得每只触手都能精确独立地运动,同时保持整个身体的协调。想象一下,就像有八个迷你大脑在完美和谐地一起工作! 我们与该研究的资深作者Clifton Ragsdale博士进行了交谈,以了解更多关于这些迷人发现的信息。 Octopus bimaculoides in motion, Image credit: Cassady S. Olson, Ragsdale Laboratory 从哺乳动物到软体动物:一段演化之旅 问:是什么让您从研究哺乳动物大脑转向研究章鱼的神经系统?答:我的科研之路始于系统神经科学,最初专注于研究脊椎动物和哺乳动物的脑回路,后来转向了神经发育的分子生物学。在获得终身教职后,我对拥有大型大脑的无脊椎动物神经系统产生了兴趣,这自然而然地将我引向了头足类动物。其中,普通章鱼尤其令我着迷,因为它的神经系统极其复杂——它总共拥有大约5亿个神经元,其中8000万个在中央大脑(相当于一只老鼠的大脑),1.2亿个在视叶,3亿个分布在八只触手上。 这种庞大的神经结构提供了一个绝佳的机会,让我们可以利用现代分子生物学、细胞生物学和其他当代技术,来增进我们对复杂神经系统如何演化和运作的理解,尽管我们需要克服许多研究障碍。 章鱼腕足的独特性 问:为什么特别关注章鱼的腕足,它们的神经系统是如何运作?答:与其他头足类动物(如鱿鱼)相比,章鱼的腕足具有独特的复杂性。虽然两者都有类似的附肢,但章鱼的腕足具有多种功能,包括探索、行走和捕食。它们的吸盘是复杂的化学感应器官,既能感觉又能尝味,拥有的味觉受体比鱿鱼的吸盘更加多样化。赋予了它们感知周围环境的惊人能力。 每条腕足包含大约4000万个神经元——相当于章鱼中枢脑半球的神经元数量。与其将此视为周围神经系统,不如将其视为中枢神经系统的一部分,类似于我们对其他动物的视网膜和脊髓的分类。可以说,章鱼基本上有八个“脊髓”,每条腕足一个。 虽然这些腕足在被切断后可以独立运作——在数小时内表现出感觉-运动反应——但这种能力并非章鱼独有,因为小鼠断开的脊髓同样可以控制运动并表现出感觉-运动反应。然而,章鱼腕足的复杂性和自主性水平是无与伦比的。 章鱼的视觉:不仅仅是“眼见为实” 问:章鱼有视觉能力吗?人们很容易过于关注它们的腕足,以至于可能会忘记它们还有眼睛!答:人们常常误以为章鱼的腕足就是它们的“眼睛”,这可能是因为腕足上具有感知功能的吸盘。但事实并非如此,章鱼拥有非常发达的眼睛和出色的视力。大而复杂的眼睛是大多数软体头足类动物的标志。实际上,如果你观察章鱼眼睛中光感受器细胞密度时,你会发现它与高视力动物(如灵长类动物,包括我们人类,甚至像鹰和隼这样的猛禽)中的光感受器细胞密度相当。如此高的光感受器密度表明章鱼具有非常高的视觉敏锐度。 有趣的是,章鱼复杂的视觉系统为我们呈现了另一个迷人的谜题。 它们的视觉系统,就像它们生物学的许多其他方面一样,似乎与脊椎动物的系统发生了趋同进化。演化在两个谱系中独立地得出了相似的复杂解决方案。这就引出了根本性的问题:它们是如何独立实现这一点?更关键的是,章鱼的眼睛和脊椎动物的眼睛在基本层面上是否遵循相同的原理运作,还是它们使用了完全不同的机制?我们还不知道这些问题的答案,这正是为什么头足类动物视觉是现代分子和细胞探索如此引人入胜的领域。在我的实验室里,我们渴望利用现代生物学的强大工具来解决这些关于软体头足类动物的开放性问题,因为还有大量令人兴奋的生物学奥秘等待着我们去发现。 分节:腕足灵活性的秘密 问:章鱼腕足神经系统的分节是如何具体地促成其执行如此复杂的弯曲、扭转和卷曲动作的非凡能力?答:把章鱼的腕足作为一个整体来看——它是一种具有抓握能力的结构,与我们所拥有的任何结构都不同。当你观察章鱼的运动时,你会注意到它们的腕足中没有骨骼。相反,它们完全由肌肉、神经组织和结缔组织以及吸盘组成。这种类型的结构被称为“肌肉水静压支架”(muscular hydrostat),类似于大象的鼻子或人的舌头。“肌肉水静压支架”能够实现几乎无限自由度的运动。 有趣的是,章鱼腕足内的肌肉结构在其整个长度上都是一致的。如果你在腕足的不同位置进行横切,你会看到相同的肌肉排列。这是一个重复的结构。如果你观察腕足的运动,并不是只有某些部分可以弯曲;整条腕足都能够弯曲、扭转、伸长和收缩。 虽然大脑显然会指示弯曲发生的位置并控制抓取等动作,但腕足的重复结构使我们推测其神经系统也可能以模块化、重复的方式组织。我们设想可能有类似的模块化神经回路沿着腕足的长度重复。这种分节的神经系统在其他蠕虫状生物中可见,例如环节蠕虫甚至昆虫幼虫。我们认为,一般来说,分节是控制蠕虫状身体或附肢的有效方法。 然后,我们的研究重点是探索腕足的神经回路。我们发现了这种神经元分节,并且令人惊讶地发现,每条腕足长度上的节段甚至比我们最初预期的还要多。这些节段似乎沿着腕足重复,但每个节段在与其相互作用的特定肌肉方面似乎都表现出局部的特化,从而产生了分工。然而,尽管存在这种局部特化,但这些节段沿着腕足保持了相似的基本结构。 除了这一初步发现之外,我们还需要进一步的研究,特别是在生理学方面,以充分了解这种分节的功能意义,以及它如何协调章鱼腕足令人难以置信的复杂运动。 Octopus bimaculoides holiding a sea shell, Image credit: Cassady S. Olson, Ragsdale Laboratory […]

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Discovering Japan's floral treasures, the Spiranthes hachijoensis orchid emerges as the latest species to be classified by Dr. Suetsugu Kenji, Botanist, Scientist, Japan

揭示日本植物的神秘面纱:须藤健治博士(Dr. Kenji Suetsugu)的新植物发现

Self portrait, Image credit: Dr. Suetsugu Kenji 揭示日本植物的神秘面纱:须藤健治博士(Dr. Kenji Suetsugu)的新植物发现 在植物新品種日益稀少的當下,日本最近發現了一種新的仙燈草屬植物,標誌着植物科學領域的一次重要進步。這種仙燈草因其精緻且半透明的外觀,以及依賴真菌而非光合作用來獲取營養的習性,在植物學中獨樹一幟。此新發現的植物,被命名爲吉野屋若律希夢(Relictithismia kimotsukiensis),不僅代表了一個新的物種,還代表了一個全新的屬,這在日本近百年來是首次。 這一發現發生在日本的植物研究熱區,該區域以其詳細且廣泛的植物研究而知名,凸顯了即便是在被研究得最透徹的環境中,依然潛藏着未解之謎。神戶大學的須藤健治教授(Dr. Kenji Suetsugu),在非光合植物研究方面是一位領先的研究者,並領導了這項研究工作。他与业余和专业的植物学家合作,突显了持续不懈的探索和跨学科研究在揭示自然界秘密中的关键作用。 Relictithismia kimotsukiensis, a primitive member of its lineage, offers a living snapshot of its family’s early evolutionary history. Named to reflect its ancient roots. Image credit: Dr. Suetsugu Kenji 深入理解生物进化与生态学 吉野屋若律希梦(Relictithismia kimotsukiensis)的发现远不止为植物学词汇增加了一个新物种,它对我们理解植物的进化和生存方式产生了深远的影响。这类植物为我们提供了森林生态的多样性及其复杂关系,而这些生态通常隐藏在落叶与幽暗的下层林区,揭露了一个鲜少被人探索的领域。 须藤健治博士对非光合植物的热情来源于他对植物生物学和生态学的广泛兴趣。他指出:“这些植物不同寻常的生存方式——不依赖光合作用,而是通过与真菌形成共生关系获取养分,开辟了一个新挑战及扩展我们对植物进化认识的丰富研究领域。” The Thismiaceae family, nourished by subterranean fungi,

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Chinaberry (Melia azedarach), a mahogany species by Dr. Hannah Hodgson, biologist, Researcher at John Innes Centre, U

揭开柠檬苦素的秘密——Hannah Hodgson博士及其合作者的一项突破性发现

Self portrait, Credit: Dr. Hannah Hodgson at John Innes Centre 揭开柠檬苦素的秘密——Hannah Hodgson博士及其合作者的一项突破性发现 约翰英尼斯中心(John Innes Centre)和斯坦福大学的联合研究小组最近揭示了制造柠檬苦素所需的完整酶,该研究发表在《科学》杂志上。柠檬苦素存在于桃花心木(Mahogany)和柑橘类(Citrus)植物中。它们被广泛用作生物农药,但在本研究之前,它们的生物合成途径尚不清楚。该团队发现并鉴定了22种参与柠檬苦素生物合成的酶,它们可以催化12种不同的酶促反应,揭示了柠檬苦素的完整生物合成途径。 柠檬苦素是一种三萜类化合物(triterpenes),具有广泛的支架修饰,导致广泛的生物活性和结构多样性。有了这个完整的生物合成途径,该团队可以轻松获得柠檬苦素,为进一步研究铺平了道路。除了生物农药,该团队还希望生产出高价值的柠檬苦素,即抗癌候选药物印苦楝内酯(nimbolide)。 我们很高兴能够采访该论文的共同第一作者、约翰英尼斯中心的博士后科学家Hannah Hodgson博士。在接下来的采访中,霍奇森博士详细阐述了他们是如何取得这一重大突破,以及柠檬苦素在临床应用和生物学研究方面的深远意义。 Seeds of Mahogany trees, Credit: Credit: Dr. Hannah Hodgson at John Innes Centre 问:祝贺你最近发表在《科学》杂志上的文章,其中揭示了植物如何制造柠檬苦素的秘密,这些柠檬苦素有可能用作抗癌药物。首先,请与我们分享你的教育和培训背景。 答:我在埃克塞特大学(英国)完成了分子生物学本科学位。这是一个广泛的学位,从生物化学到海洋生物学,包括在昆士兰大学(澳大利亚)学习一年,我喜欢它,并且真正让我大开眼界,了解到植物和作物科学的研究是多么有趣和多样化。此后,2015年,我在伯明翰(英国)的NHS测序实验室短暂担任医疗保健科学助理。然后搬到诺里奇(英国)攻读博士学位,我于2020年在约翰英尼斯中心(John Innes Centre, JIC)由安妮教授(Dr. Anne’s Osbourn)主持的奥斯本小组完成了关于柠檬苦素生物合成的研究。这是一个很棒的项目,当我开始研读博士时,这条途径完全没有特征,但随著项目的进展,该项目的广度使我能够接受大量不同的技能培训。 问:请告诉我们更多关于这项发表在《科学》杂志的研究. 答:柠檬苦素是一种化学物质(或植物天然产物),仅由属于桃花心木或柑橘科的植物所制成。在《科学》杂志上发表的文章中,我们解释了如何发现和表征生产简单柠檬苦素所需的所有酶(生物机器),如氮杂二酮(来自桃花心木家族)和 基达内酯 khidalactone A(来自柑橘家族)。文章描述了22种新酶,其中12种来自柑橘属植物,10种来自桃花心木,其中一些具有新的化学作用。例如,通过进行支架重排,我们首次发现参与非常保守的甾醇初级代谢的酶已经在桃花心木和柑橘中进化,在柠檬苦素的生物合成中发挥关键作用。 桃花心木(Mahogany)系列的工作由我和JIC的同事进行,柑橘(Citrus)则由斯坦福大学的合作者进行。这项工作面临许多挑战,例如,在我们对桃花心木酶进行微调之前,我们首先必须为苦楝(Melia azedarach,该家族中的一种柠檬苦素生产树),生成基因组和表达数据。随著基因测序技术、代谢物分析和生物技术的进步,现在可以表征真正复杂的植物天然产物途径,例如我们对柠檬苦素所做的研究。但是在2016年我开始攻读博士学位时,这项工作几乎不可能达成。 问:是什么让柠檬苦素如此有趣? 答:柠檬苦素是一组极其多样化的化学物质(迄今为止已鉴定出 2,000 多种)。它们是一种称为三萜类化合物(triterpenes)的化学物质,具有30个碳主链的多环结构。与其他三萜类化合物不同,柠檬苦素类化合物的化学支架被广泛重排。在柠檬苦素的生物合成中,会形成一个呋喃环,导致4个碳的损失,这是我们在《科学》杂志论文中首次描述的过程。柠檬苦素生物合成中,可能会出现各种其他环开口,其中之一在我们的《科学》杂志论文中得到了表征。这些环开口,加上广泛的氧化,构成了柠檬苦素的巨大多样性,使它们让化学家如此著迷。此外,许多柠檬苦素具有生物活性,但对人类无毒,因此对人类具有当前和潜在的未来用途。最著名的例子是来自桃花心木类的印楝树的柠檬苦素,即印苦楝子素。印苦楝子素是一种有效的昆虫拒食剂/毒剂,可在环境中迅速降解,被认为对蜜蜂友好。因此,印苦楝子素是一种强大的作物保护剂,基于印楝种子的溶液可用于传统和商业配方。除了作物保护用途外,柠檬苦素的许多潜在药物用途也有报导,最突出的是印苦楝内酯(nimbolide)的抗癌作用,这是另一种印楝类柠檬苦素。 问:你在进行这项研究时,使用了什么方法和设备? 答:首先,我们使用下一代测序技术(PacBio、Hi-C 和 RNA-seq)为苦楝(印楝的近亲)生成了基因组和表达数据。然后我们利用这些资源寻找我们怀疑可能参与柠檬苦素生物合成的候选酶。为实现这一目标,我们主要采用表达分析方式(确定植物不同组织中酶的“开启”或“关闭”方式)。我们使用了苦楝(M.azedarach)的表达模式,此表达模式已经在我们于2019年发表的PNAS论文(叶柄和根中柠檬苦素生物合成酶的高表达)中建立,以找到具有相似表达模式的酶。一旦我们有了候选酶的列表,我们就克隆它们,然后在烟草类(本塞姆氏烟草)宿主植物中使用瞬时表达来测试不同的酶组合,并由一种特殊的细菌“农杆菌”做介导。该系统使酶得以在植物中表达并让我们轻松分析这些在宿主植物而非原本植物中的酶的活性。通过LCMS(液相色谱-质谱法)来分析由这些酶所引起的化学变化。最后,如果通过LCMS,我们确定了一种不知道其结构的新化学物质,我们会进行大规模的瞬时表达(使用真空渗透器来加速该过程),然后使用制备型HPLC来纯化新产生的未知化学结构。一旦我们有了一种纯化学物质,我们就可以通过NMR(核磁共振)确认其结构,以及每种酶的活性。 问:通过揭示完整生物合成途径中的酶,你的下一步研究是什么? 答:虽然我们现在知道简单的柠檬苦素的完整生物合成途径,如氮杂二酮,但对更复杂的柠檬苦素如印苦楝子素(azadirachtin),还有更多的生物合成步骤仍然未知。我们希望了解接下来的步骤,以便能够制造出更有用/更复杂的柠檬苦素。此外,与我们发表在《科学》杂志论文中发现的22种酶一样,柠檬苦素的复杂性意味著我们很可能会在剩余的印苦楝子素途径中发现有趣且新颖的酶,这使它成为一个非常令人兴奋的项目。最后,我也对如何提高寄主植物(本塞姆氏烟草)的柠檬苦素产量感兴趣。鉴于如果我们能够制造更多的柠檬苦素,这对工业和一般人类来说可能更有用。

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Artistic illustration of the resonant fractal continuity of the energetic basis of reality and consciousness that has a structured essence without being categorizable into discrete object entities. (Free download of colorful-light-swirls-21710.jpg )

Dr. Christopher Tyler, a Visionary Scientist Beyond Vision

Self Portrait, Courtesy: Dr. Christopher Tyler Dr. Christopher Tyler, a Visionary Scientist Beyond Vision We are immensely honored to be able to speak with the famed visual neuroscientist Dr. Christopher Tyler who is the Head of the Smith-Kettlewell Brain Imaging Center in San Francisco and Professor at the Division of Optometry and Vision Sciences, City

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Water drop by Ted Kinsman, photographer and professor teaching at Rochester Institute of Technology (RIT), USA

短暂且不易见的摄影

短暂且不易见的摄影 我们非常荣幸能够采访罗切斯特理工学院(RIT)的金斯曼(Ted Kinsman)教授。金斯曼教授是位在科学和工程领域方面,有著杰出成就的摄影师。由于他在摄影和图像处理上的超凡创意和技术,为他嬴得了许多享有声望的全美/国际奖项,其中包括生物通信协会(BioCommunications Association)所颁予的最高荣誉奖 – 路易斯·施密特奖(Louis Schmidt Award)。 Thin-film interference on a soap film, Courtesy: Ted Kinsman 金斯曼教授不时地发明仪器来检验他的新想法,因此他能够创造独特而且先进的图像。他的独创性没有被媒体/娱乐业所忽视。他的图像曾被杂志,报纸,探索频道,X档电视连续剧,南方公园等使用。 Dielectric Film Sparks, Courtesy: Ted Kinsman 从下面的采访中,我们希望读者能够深入地了解金斯曼教授在摄影方面的思维和创造过程。不過,我们更希望读者能被金斯曼教授的超级脑力所启发。 Mcannabis, Courtesy: Ted Kinsman 问:你在摄影领域方面, 成就非凡。首先,请向我们的读者介绍你自己。 答:在加入RIT摄影科系之前,我曾担任过光学工程师,物理学家和物理学讲师。在2019年,我获得了享有声望的路易斯·施密特奖,这是生物通信协会授予的最高荣誉奖。该奖项表彰了对生物通信进展做出杰出贡献的人士。我从世界各地的提名人中被挑选出来,因为我擅长使用物理学和技术来拍摄照片。我最近出版的书《大麻制品:显微镜下的大麻》是我获得这一荣誉的原因之一。该出版物在网上获得了极大的欢迎,并被《商业内幕》(Business Insider)和BNN彭博社(BNN Bloomberg)等新闻媒体报导。 Dance, Courtesy: Ted Kinsman 我是少数能够以不到1 / 1,000,000秒的速度进行摄影的高速摄影师。我还能够在光谱的X射线区域拍摄照片,在那个领域中,我通常是为了书籍和杂志的图像来进行拍摄。我还发明了一台可以用咖啡打印肖像的机器,一台复印机,一台在骑乘时可以记录呼吸的自行车,以及拥有其他多项疯狂发明。 我的作品出现在《发现频道》,《犯罪现场调查》(CSI),《 X档案》,《南方公园》,《泰拉·班克斯》和《冰雪奇缘》系列中。我目前是摄影艺术与科学学院(SPAS)的副教授,我在这里教授摄影仪器,扫描电子显微镜和高速成像。 Mona Lisa in wine, Courtesy: Ted Kinsman 问:你似乎拥有无穷的灵感和创造力。 ”受到启发”对你意味着什么? 答:我一直是一位富有创造力的人;我对科学领域有足够的了解,所以可以有效地开发那些有待硏究的领域。我非常喜欢制作新颖的项目,并引导学生们朝着崭新而有趣的方向发展。至于会想出什么样的点子,我有很多点子可能永远都不会用到。 问:这个学期,你的创造力都发挥在那些方面? 答:基本上,我花时间落实我想尝试的许多项目。 

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Water drop by Ted Kinsman, photographer and professor teaching at Rochester Institute of Technology (RIT), USA

Photography of the Ephemeral and Unseen

Photography of the Ephemeral and Unseen We are very honored to be able to interview Professor Ted Kinsman at Rochester Institute of Technology (RIT). Professor Kinsman is an outstanding photographer in the realms of science and technology. He has received numerous prestigious national/international awards for his creativity and achievements in photography and image processing including

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